BIOB40: Fundamentos de Taxonomia Zoológica

Professor Marcelo Felgueiras Napoli
Instituto de Biologia
Universidade Federal da Bahia
Curso de Ciências Biológicas

 

Assunto 1. Coleções Zoológicas

  • Tema a que pertence: TEMA I – Organizando os Objetos de Estudo

  • Índice: (i) Apresentação do Professor e do Curso; (ii) Coleções Zoológicas.coleções biológicas de apoio ao inventário, uso sustent´vale

  • Slides da Aula: Apresentação Geral    Slides Aula 01 (A)    Slides Aula 01 (B)

  • Leituras obrigatórias: (1) Papavero N. (org.) (1994). Fundamentos práticos de Taxonomia Zoológica. 2a. edição. São Paulo: Editora da Universidade Estadual Paulista. 285 pp. (2) Lewinsohn T.M. & Prado P.I. (2002) Biodiversidade brasileira. São Paulo: Editora Contexto. 176 pp. [OPÇÃO: Link para baixar publicação similar destes autores] (3) Kemp C. (2015) The endangered dead. Nature, 15: 292-294 (Link para baixar o artigo). (4) Young P.S. (2003) Avanços na integração dos acervos zoológicos depositados em instituições brasileiras. In: Peixoto A.L. (org.), Coleções Biológicas de apoio ao inventário, uso sustentável e conservação da biodiversidade. Rio de Janeiro, Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro. pp. 215-229. (5) Caramaschi, U. (1987) Manual de técnicas para preparação de coleções zoológicas. 1. Generalidades. Campinas, SP, Sociedade Brasileira de Zoologia, 21p.

  • Leituras recomendadas: (1) Joly C.A., Haddad C.F.B., Verdade L.M., Oliveira M.C., Bolzani V.S. & Berlinck R.G.S. (2011) Diagnóstico da pesquisa em biodiversidade no Brasil. Revista USP, São Paulo, (89): 114-133. Acessado em: 01/III/2015. (2) Marinoni L. & Peixoto A.L. (2010) As coleções biológicas como fonte dinâmica e permanente de conhecimento sobre a biodiversidade. Ciência e Cultura [online], 62(3): 54-57. Disponível em: <http://cienciaecultura.bvs.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0009-67252010000300021&lng=en&nrm=iso>. ISSN 2317-6660. Acessado em 01/III/2015. (3) Peixoto A.L., Barbosa M.R.V., Menezes M. & Maia L.C. (2006) Diretrizes e estratégias para a modernização de coleções biológicas brasileiras e a consolidação de sistemas integrados de informação sobre biodiversidade. Brasília: Centro de Gestão e Estudos Estratégicos: Ministério da Ciência e Tecnologia. 324 pp. Disponpivel em: <http://www.cgee.org.br/publicacoes/ppbio.php>. Acessado em 01/III/2015. [Este livro inclui a publicação No. 2, ver acima] .(4) Zaher H. & Young P.S. (2003) As coleções zoológicas brasileiras: panorama e desafios. Ciência e Cultura [online], 55(3):24-26 pp. Disponível em: <http://cienciaecultura.bvs.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0009-67252003000300017&lng=en&nrm=iso>. ISSN 2317-6660. Acessado em 01/III/2015.

  • Leituras (para baixar em PDF):
        Leitura (Manual do CadZoo)    Leitura (Livro Tombo CadZoo)

Assunto 2. Publicações Zoológicas e Mapeamento das amostras de estudo

Tema a que pertence: TEMA I – Organizando os Objetos de Estudo

Índice: (i) Mapeamento das amostras em ArcView; (ii) Publicações Zoológicas.

  • Slides da Aula: Slides Aula 03

  • Roteiro de aula prática: Mapeamento de localidades

  • Leituras obrigatórias: (1) Martins, U. (1994) Tipos de Publicações Zoológicas. In.: Papavero N. (org.), Fundamentos práticos de Taxonomia Zoológica. 2a. edição. São Paulo: Editora da Universidade Estadual Paulista. Pp. 61-68. (2) Papavero, N. & Martins, U. (1994) Itens da publicação taxonômica. In.: Papavero N. (org.), Fundamentos práticos de Taxonomia Zoológica. 2a. edição. São Paulo: Editora da Universidade Estadual Paulista. Pp. 69-106. (3) Garda, A. (2012) Uma nota é um artigo completo publicado em periódico? Herpetologia Brasileira, 1(3), 106-108.

  • Exemplos de artigos e notas (Consultar Professor): Artigo Completo Exemplo (Descrição de Espécie), Nota Exemplo (Distribuição Geográfica), Nota Exemplo (História Natural), Artigo/Coorrespondence/Short Communication (Girino, Bioacústica), Inventário Faunístico (Tipo 1, Tipo 2), Lista Comentada.

Assunto 3. Fundamentos de Fotografia Científica

  • Tema a que pertence: TEMA II – Ferramentas para a Taxonomia

Assunto 4. Fundamentos de Ilustração Científica

  • Tema a que pertence: TEMA II – Ferramentas para a Taxonomia

Assunto 5. Nomenclatura Zoológica: Uma síntese

  • Tema a que pertence: TEMA III – O Sistema de Classificação Zoológica

    • Slides da Aula: Slides Aula 08

    • Exercícios (2015.1): Leitura obrigatória para exposição em sala de aula (seminário) por discentes: (1) Caramaschi, U. & Napoli, M.F., 2004. The nomenclatural status of the synonyms of Hyla pardalis Spix, 1824, and the taxonomic position of Hyla biobeba Bokermann & Sazima, 1974 (Anura: Hylidae). Journal of Herpetology, 38(4):500-509. [solicitar ao professor] (2) Napoli, M.F. & Caramaschi, U., 1999. The taxonomic status of Hyla elongata Lutz, 1925 (Anura: Hylidae). Journal of Herpetology 33(3):484-487. [solicitar ao professor] (3) Feio, R. N.; Napoli, M. F. & Caramaschi, U. 2006. Considerações taxonômicas sobre Thoropa miliaris (Spix, 1824), com revalidação e redescrição de Thoropa taophora (Miranda-Ribeiro, 1923) (Amphibia, Anura, Leptodactylidae). Arquivos do Museu Nacional, Rio de Janeiro, 64(1):41-60. [solicitar ao professor] (4) Pinheiro, P.D.P., Faivovich, J., Langone, J.A. & Kwet, Axel (2014) The identity of Hyla leucotaenia Burmeister, 1861 (Anura: Hylidae). Zootaxa 3884 (2): 179–184. [solicitar ao professor] (5) Caramaschi & Niemeyer, E. (2010) The nomenclatural status of Rana gaimardii Bory de Saint-Vincent, 1828, and Hyla quoyi Bory de Saint-Vincent, 1828 (Anura, Hylidae). Zootaxa 2655: 63–68 [solicitar ao professor]. (6) Caramaschi, U. & Canedo, U. (2006) Reassessment of the taxonomic status of the genera Ischnocnema Reinhardt and Lütken, 1862 and Oreobates Jiménez-de-la-Espada, 1872, with notes on the synonymy of Leiuperus verrucosus Reinhardt and Lütken, 1862 (Anura: Leptodactylidae). Zootaxa 1116: 43–54. [solicitar ao professor].

Assunto 6. Classificações Taxonômicas e a Sistemática Filogenética

  • Tema a que pertence: TEMA III – O Sistema de Classificação Zoológica

  • Slides da Aula: Slides Aula 10 [atualização 03-07-2017]

    • Leituras obrigatórias (2015.1): (1) Amorim, D. S. (2005) Fundamentos de Sistemática Filogenética. Ribeirão Preto, Holos Editora, 156 p. Capítulos de leitura obrigatória para este curso: Prefácio (pp. 9-10); Prólogo (pp. 11-12); Capítulo 1 - Sistemática e diversidade biológica (pp. 15-18); Capítulo 2 - Tempo e forma: plesiomorfia e apomorfia (pp. 19-29); Capítulo 3 - Forma e agrupamentos taxonômicos: grupos monofiléticos e merofiléticos (p. 30-35); Capítulo 4 - Semelhanças compartilhadas... (pp. 36-43); Capítulo 5 - Protocolos de análise e matrizes de informação (pp. 45-45-56); Capítulo 6 - Informações em cladogramas (pp. 57-69, 72-73); Capítulo 7 - Construção de cladogramas (pp. 74-80; 84-87); Capítulo 8 - Noções básicas sobre classificações biológicas (pp. 88-98); Capítulo 9 - Classificações filogenéticas (pp. 99-109; 112-113); Capítulo 10 - Ordenação do conhecimento biológico (pp. 114-116).

    • Leituras Recomendadas: (1) Papavero, N. & Balsa, J. (1986) Introdução histórica e epistemológica à biologia comparada, com especial referência à biogeografia. I. Do Gênesis ao fim do Império Romano do Ocidente. Belo Horizonte, Biótica - Produtos Técnico-Científicos e Agroindustriais / Sociedade Brasileira de Zoologia, 168 p. (2) Simpson, G. G. (1962) Princípios de Taxonomia Animal. Lisboa, Fundação Calouste Gulbenkian, 254 p.

    • Exercícios (2015.1): (1) Exercício de Construção de Cladograma a partir de dados de lagartos hipotéticos (a resolução será realizada junto com o professor em sala de aula; não será disponibilizado gabarito).

    • Assunto 7. Conceitos de espécie: uma síntese

      • Tema a que pertence: TEMA IV – "Revelando" Espécies

      • Slides da Aula: Slides Aula 13

        • Leituras obrigatórias (2017.1) - (i) Kischlat (2005) Os conceitos de espécie: uma abordagem prática. Caderno La Salle XI, 2(1):11-35; (ii) Simpson, G. G. (1962) A espécie e as categorias inferiores. In: Princípios de Taxonomia Animal. Lisboa, Fundação Calouste Gulbenkian, pp. 151-190; (iii) Wheeler, D. & Meier, R. (2000) Species concepts and phylogenetic theory: A debate. New York, Columbia University Press, 230 p.; (iv) de QUEIROZ, K. (2007) Species concepts and species delimitation. Systematic Biology 56(6):879-886.

        • Leituras recomendadas (2017.1) - (i) Mayr (1996) What is a Species, and What is Not? Philosophy of Science, Vol. 63 (June 1996) pp. 262-277; (ii) Winston, Judith E. (1999) Describing Species: Practical Taxonomic Procedure for Biologists. New York, Columbia University Press; (iii) Character displacement. Disponível em: http://www.iaszoology.com/character-displacement/ (último acesso em 25/07/2017); (iv) Schluter, D. (1986) CHARACTER DISPLACEMENT BETWEEN DISTANTLY RELATED TAXA? FINCHES AND BEES IN THE GALAPAGOS.  The American Naturalist, 127(1):  95-106. (vi) Grant, P.R. 1972. Convergent and divergent character displacement. Biological Journal of the Linnean Society 4(1):39-68 · March 1972 [Revisão mais cética sobre Character displacment].

    Assunto 8. Taxonomia Integrativa: Taxonomia como Ciência e a Crise na Taxonomia

    • Tema a que pertence: TEMA IV – "Revelando" Espécies

    • Slides da Aula: Slides Aula 14

      • Leituras obrigatórias (2017.1): (1) de QUEIROZ, K. Species concepts and species delimitation. Syst. Biol. 56(6):879–886. Baixe aqui. (2) PADIAL et al. (2010) The integrative future of taxonomy. Frontiers in Zoology 2010, 7:16. Baixe aqui.(3) DAYRAT, B. (2005) Towards integrative taxonomy. Biological Journal of the Linnean Society, 85:407–415. Baixe aqui. (4) Schlick-Steiner et al. (2010) Integrative Taxonomy: A Multisource Approach to Exploring Biodiversity. Annual Review of Entomology Vol. 55: 421-438 (Volume publication date January 2010). Baixe aqui. (5) Carvalho et al. (2013) Does counting species count as taxonomy? On misrepresenting systematics, yet again. Cladistics (2013) 1–8.

      • Leituras recomendadas (2017.1) - SEIFERT, B., RITZ, M. & CSŐSZ, S. 2013. Application of exploratory data analyses opens a new perspective in morphology-based alpha-taxonomy of eusocial organisms. Myrmecological News 19:1-15.

      • Assunto 9. Organizando os objetos de estudo | Tabelamento de dados de características não-morfométricas | Análises não-paramétricas como testes de hipóteses | Análises paramétricas em dados morfométricos

        • Tema a que pertence: TEMA IV – "Revelando" Espécies

        • Slides da Aula: Slides Aula 16

          Roteiro de Aula Prática: Baixe aqui

          • Leituras obrigatórias (2015.1): (1) NAPOLI, M. F. (2003) Fundamentos da Prática Estatística em Taxonomia Zoológica. Baixe aqui.

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